- готовит для Совета Министров предложения по проектам законов и Основ законодательства Союзного государства, по унификации законодательств государств-участников;
- организует разработку предложений по стратегии развития Союзного государства и вносит их в Совет Министров;
- организует реализацию положений Договора и Программы, подготовку предложений по выполнению задач Союзного государства;
- координирует работу отраслевых и функциональных органов Союзного государства и их взаимодействие с национальными органами государств-участников;
- изучает и анализирует работу отраслевых и функциональных органов Союзного государства, вносит в Совет Министров предложения по улучшению их деятельности;
- обеспечивает деятельность Высшего Государственного Совета и Совета Министров в соответствии с их регламентами и является ответственным за подготовку их заседаний;
- разрабатывает проект бюджета Союзного государства, организует исполнение бюджета Союзного государства и готовит проекты отчетов о его исполнении;
- совместно с соответствующими органами государств-участников Союзного государства осуществляет предварительное рассмотрение программ, проектов и мероприятий Союзного государства, представляет заключения по ним в Совет Министров, а также информирует Совет Министров о ходе их выполнения;
- направляет принятые Высшим Государственным Советом и Советом Министров акты заинтересованным органам и организациям;
- подготавливает для Высшего Государственного Совета и Совета Министров заключения по проектам вносимых на их рассмотрение актов Союзного государства, а также проектам международных договоров Союзного государства;
- осуществляет контроль за выполнением решений Высшего Государственного Совета и Совета Министров, а также поручений Председателя Высшего Государственного Совета, Председателя Совета Министров. При необходимости подготавливает и представляет в Совет Министров предложения о принятии дополнительных мер по обеспечению выполнения этих решений;
- подготавливает совместно с заинтересованными органами Союзного государства и государств-участников проект ежегодного Послания Высшего Государственного Совета Парламенту Союзного государства;
- обеспечивает взаимодействие Совета Министров с Парламентом, Судом, Счетной палатой Союзного государства;
- формирует и вносит на рассмотрение Высшего Государственного Совета и Совета Министров проекты повестки их заседаний, планов работы;
- осуществляет хранение актов Высшего Государственного Совета и Совета Министров;
- выполняет другие функции, возлагаемые на него решениями Высшего Государственного Совета.
